Transcriptome

Les cellules, en réponse à un stress, une molécule toxique, un rayonnement UV…, peuvent déclencher un phénomène inflammatoire.
Celui-ci se traduit par l’induction de l’expression d’un grand nombre de gènes codant pour des cytokines pro- ou anti-inflammatoires, leurs récepteurs, des chimiokines et de multiples molécules affectant la réponse inflammatoire.
En étudiant en temps réel l’expression génomique d’un certain nombre de gènes cibles, nous sommes en mesure d’appréhender les effets d’une ou plusieurs drogues sur des cellules humaines, à savoir évaluer leur pouvoir pro-inflammatoire sur ces cellules.

La PCR quantitative des cytokines humaines Th1/Th2 et de leurs récepteurs profile 84 gènes clés de la réponse inflammatoire listés ci-dessous. En utilisant, la PCR en temps réel, nous pouvons facilement et de source sure analyser l’expression d’un panel ciblé de gènes impliqués dans la médiation des réactions de la cascade immune durant l’inflammation.

Groupes de gènes fonctionnels

Chemokine Genes:

C5, CCL1 (I-309), CCL11 (eotaxin), CCL13 (mcp-4), CCL15 (MIP-1d), CCL16 (HCC-4), CCL17 (TARC), CCL18 (PARC), CCL19, CCL2 (mcp-1), CCL20 (MIP-3a), CCL21 (MIP-2), CCL23 (MPIF-1), CCL24 (MPIF-2 / eotaxin-2), CCL25 (TECK) , CCL26, CCL3 (MIP-1a), CCL4 (MIP-1b), CCL5 (RANTES), CCL7 (mcp-3), CCL8 (mcp-2), CXCL1, CXCL10 (IP-10), CXCL11 (I-TAC / IP-9), CXCL12 (SDF1), CXCL13, CXCL14, CXCL2, CXCL3, CXCL5 (ENA-78 / LIX), CXCL6 (GCP-2), CXCL9, IL13, IL8.

Chemokine Receptors:

CCL13 (mcp-4), CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CX3CR1, IL8RA, XCR1 (CCXCR1).

Cytokine Genes:

CD40LG (TNFSF5), IFNA2, IL10, IL13, IL17C, IL1A, IL1B, IL1F10, IL1F5, IL1F6, IL1F7, IL1F8, IL1F9, IL22, IL5, IL8, IL9, LTA, LTB, MIF, SCYE1, SPP1, TNF.

Cytokine Receptors:

IFNA2, IL10RA, IL10RB, IL13, IL13RA1, IL5RA, IL9, IL9R.

Other Genes Involved in Inflammatory Response:

ABCF1, BCL6, C3, C4A, CEBPB, CRP, ICEBERG, IL1R1, IL1RN, IL8RB, LTB4R, TOLLIP